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艱難梭菌及其檢測技術研究進展

1 艱難梭菌簡介

艱難梭菌又叫“艱難梭狀芽孢桿菌”,最早發(fā)現(xiàn)于上世紀30年代,是造成醫(yī)院感染和住院病患腹瀉的常見。普通人群中約有3%的人的腸胃中都有這種細菌,在正常情況下,該細菌受制于人體內(nèi)的其他細菌,不會危害人體健康。但對于長期或是大量服用抗生素的病人而言,這種細菌是可怕的,甚至是致命的。這是由于藥物破壞了人體腸胃中各種菌類之間的平衡,所以容易導致“艱難梭菌”感染。就“艱難梭菌”本身而言,其致命性并不高,在0.6%到1.5%之間,但由于感染該細菌通常會伴隨偽膜性結腸炎的出現(xiàn),一旦出現(xiàn)這種情況,死亡率就會猛增到35%到50%。而且,與所有的細菌一樣,“艱難梭菌”會通過突變產(chǎn)生新的變種,而這些變種細菌的毒性和對人體的危害性、致命性通常也更強。

 

2 艱難梭菌的傳統(tǒng)檢測方法

所有艱難梭菌菌株皆表達抗原谷氨酸脫氫酶,但是艱難梭菌分為產(chǎn)毒菌株和不產(chǎn)毒菌株兩種。僅產(chǎn)毒菌株分泌毒素A和毒素B。毒素A和毒素B都可以導致艱難梭菌相關疾病的發(fā)生。艱難梭菌的檢測主要是通過對疑似病例的糞便中毒素的檢測完成[1]。直接糞便毒素測定包括細胞毒素測定(CTA)和酶測定(EIA)[2]。CTA中毒素B的檢測被認為是艱難梭菌檢測的金標準[3]。CTA涉及到將培養(yǎng)的細胞暴露到有或者沒有抗毒素存在的排泄抽提物中。如果排泄物樣本是艱難梭菌陽性,則對沒有經(jīng)過抗毒處理的培養(yǎng)細胞有毒害作用[4]。

艱難梭菌也可以通過在厭氧條件下培養(yǎng)而被檢測。這種方法具有很高的靈敏度,但是也很耗費時間,需要超過三天的時間。另外,這種方法不能區(qū)分產(chǎn)毒菌株和非產(chǎn)毒菌株。利用EIA對細菌培養(yǎng)分離株進行進一步測試,主要是鑒定艱難梭菌菌株是否產(chǎn)毒 [5]。

傳統(tǒng)的C.diff測驗都是根據(jù)以下三種方法中的一種或者結合幾種進行的:細胞培養(yǎng)測定中的細胞毒素檢測; 艱難梭菌毒素A、腸毒素、或者毒素A和毒素B的酶免疫測定(EIA)檢測; 艱難梭菌的厭氧培養(yǎng)。[6]

 

2.1 細胞培養(yǎng)測定中的細胞毒素檢測

過濾的糞便抽提物加到微量滴定板上處于生長的健康的單層細胞中,培養(yǎng)48h。如果樣本中存在細胞毒素(一般是艱難梭菌毒素B),將會導致單層細胞聚集,脫離板(稱為細胞病變效應,CPE)。非特定細胞毒素的鑒別是通過加入向第二個孔(孔內(nèi)有病人的糞便抽提物)加入特定的抗毒素(實際上是培育一種相似的C. sordellii)。只有起始的CPE是由于艱難梭菌毒素B引起的,在相應的孔中抗毒素才會阻止CPE。一般認為,細胞毒素中和(CTN)測定是實驗室檢測中最靈敏和精確的,但是存在兩個主要的缺點:出結果的速度不夠快,從而影響了及時的臨床診斷;這種方法需要專業(yè)的技術和連續(xù)的組織培養(yǎng)[7]。

 

2.2 艱難梭菌毒素A、腸毒素、或毒素A和毒素B的酶免疫測定(EIA)檢測

一些商業(yè)產(chǎn)品通過檢測在主要存在于有生長力的艱難梭菌細胞的一種蛋白質(zhì),叫谷氨酸脫氫酶(GDH),結合毒素檢測。因為糞便中的毒素易分解,特別是如果在轉(zhuǎn)移到實驗室的過程中經(jīng)過耽誤,毒素測驗很可能會錯誤地成陰性,然而GDH是相當穩(wěn)定的,通常可以表明微生物的存在。這種方法的缺點包括缺乏靈敏性,一些菌株毒素的改變使得不能被商業(yè)化產(chǎn)品檢測出來;一些無毒素的艱難梭菌也可分泌出GDH(假陽性結果);一次進行這些檢測的費用;如果EIA測驗是成批進行以提高工作流程和成本效益,將會使周轉(zhuǎn)時間延長。

 

2.3 艱難梭菌的厭氧培養(yǎng)

培養(yǎng)是所有檢測中最靈敏的方法。但是必須進行二次檢測以判斷產(chǎn)物毒素是否存在,因為非毒性菌株還是比較常見的。這就延長了出結果的周轉(zhuǎn)時間。另外,艱難梭菌的芽孢是極其堅固的,但是有生長力的形式卻比較脆弱,必須維持厭氧環(huán)境以使其恢復生長。一種特殊的介質(zhì)——環(huán)絲氨酸-頭孢西丁果糖瓊膠(CCFA),必須在厭氧環(huán)境下儲存并培養(yǎng)48h,以達到最佳的恢復。因為培養(yǎng)技術的困難和結果輸出的延遲,在相對很少的檢測性實驗室中會對艱難梭菌進行培養(yǎng)。早先的研究區(qū)分疾病通常包括在內(nèi)鏡檢查術下宏觀觀察粘膜的外觀,通過組織病理學比較(假膜是由剝落的細胞組成的白色或者黃色粗糙的物質(zhì)構成),或者在結腸粘膜的活體組織上觀察到的的微觀病變。目前這種有擴散性的檢測在今天已經(jīng)幾乎不被利用了,實驗室測驗是檢測的主要模式。這使得測驗和標準的選擇至關重要。

最近已經(jīng)有文獻報道了采用兩步方法后的更好的結果:對微生物本身非常靈敏的檢測,首先利用EIA檢測GDH,緊接著對細胞毒素和中和的二次檢測。因為在所有病人的糞便標本中的艱難梭菌,對GDH的快速檢測將都是陽性的,不管毒素的性質(zhì)是否已經(jīng)在運輸過程中分解,這種方法是最靈敏的。糞便在其最初的檢測中被認為是陰性的,即可立刻被報告時陰性的。因為第一個樣本是最有價值的??醋o者可以進行其他的檢測方法,并使得改變抗生素療法決定的立即必要性得到阻止。實驗室必須繼續(xù)進行細胞毒素測定,這使得周轉(zhuǎn)時間增加,或者培養(yǎng)和毒素測驗的時間增加。然而,兩步方法是最有效的。

 

3 艱難梭菌的快速檢測方法

目前市場上有很多艱難梭菌快速檢測方法,其中以Meridian Premier C. difficile Toxin A+B ELISA, TechLab Tox A/B Quik Chek, TechLab Toxin A/B II, ImmunoCard Toxin A&B的檢測效果相對較好。ImmunoCard Toxin A&B test最大化地縮短了檢測時間,整個過程為16-24分鐘。另外,這種測驗是一個單項測驗EIA,可能在臨時檢測的應用上是實用可行的。其他的快速檢測方法需要自動板閱讀設備、板清洗機、或者一些消耗品(如不包括在檢測試劑盒在內(nèi)的準備試劑盒等)。大多數(shù)的研究都強調(diào),需要更加縝密的方法如CTA或者厭氧培養(yǎng)等,以確認快速檢測的結果。另外,快速檢測可以用來作為鑒定艱難梭菌陽性個體的初步的篩選方法,可以減少在艱難梭菌感染檢測的延誤。但是這些快速檢測普遍存在靈敏度低和陽性預測值率等缺點[5]。因此,臨床上迫切需要一種快速靈敏的艱難梭菌檢測方法。

 

4 艱難梭菌分子生物學檢測方法

目前的有研究表明,利用分子學方法進行艱難梭菌檢測更有效[12,13]。 Peterson 等評價了real- time PCR檢測是利用引物以毒素B基因的一段保守區(qū)域為靶點。 由于所有產(chǎn)毒菌株都攜帶毒素B(有些缺少毒素A),這被視為是產(chǎn)毒菌株的很好的替代標記。

這個研究是分兩個階段進行。第一階段是將送到實驗室的618個艱難梭菌檢測標本,進行普通的EIA測驗與PCR測驗比較。與結合毒素測驗的厭氧培養(yǎng)的金標準比較,EIA的靈敏度為67%,精確度為92%,而PCR的靈敏度為94%,準確度為97%。在這個階段,調(diào)查者還設定了一套明確艱難梭菌相關性腹瀉診斷的標準,并發(fā)現(xiàn)幾乎所有真正的CDAD病例每天會有3次或者更多的排便。對符合該標準的采自病人的370個標本,PCR檢測的靈敏度比EIA的更高(93% vs. 73%)。real-time PCR和厭氧培養(yǎng)測定皆比酶免疫測定(EIA)更加靈敏(P<.01 to P<.05)。作者總結,與EIA相比,real-time PCR是一個更加靈敏,相對迅速的測驗,應該在臨床實踐中考慮替代用來檢測毒性艱難梭菌的酶免疫測定。

目前市場上推出的艱難梭菌快速分子檢測有BD GeneOhm real-time PCR test和Cepheid公司的GeneXpert C. difficile快速檢測方法等。Stamper等(2009)評價了BD GeneOhm real-time PCR test的檢測效果,引用的標準是商業(yè)化應用的CTA(Wampole C.difficile Toxin B test)。通過研究表明,GeneOhm的靈敏度為83.6% (95% CI: 74.3% to 92.9%) ,精確度為98.2% (96.8% to 99.6%),PPV 和NPV分別為 89.5% (81.5% to 97.4%) 、97.1% (95.3% to 98.9%)。整個GeneOhm real-time PCR test大概需要3h,而一般CTA需要24-48h,厭氧培養(yǎng)的時間大約為5天。作者總結認為,GeneOhm是一個快速靈敏的C.difficile分子檢測方法[14]。

而Cepheid公司推出的GeneXpert C. difficile快速分子檢測,具有更強大的優(yōu)勢。整個檢測過程僅需要30分鐘。與肉湯富集產(chǎn)毒培養(yǎng)進行比較,其靈敏度為93.5%,精確度為94.0%。與現(xiàn)有的PCR檢測、細胞毒素測定、EIA等各種檢測方法比較,其具有高度的靈敏度。因此,相比之下,GeneXpert C. difficile檢測是一種更加快速、靈敏的檢測方法。

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